cBioPortal OncoPrint MCP

Ce qu'il fait

Cette application MCP connecte les assistants IA à cBioPortal, leur permettant de rendre des visualisations de données génomiques complexes. Elle se concentre spécifiquement sur les OncoPrints (grilles d'altérations gènes x échantillons) et les résumés d'études, transformant les données brutes de génomique du cancer en interfaces utilisateur React interactives au sein de l'interface de chat.

Fonctionnalités clés

• OncoPrints Interactifs : Visualise les altérations génétiques à travers plusieurs échantillons en utilisant des données en direct de l'API REST de cBioPortal.
• Résumés d'Études : Rendu de cartes de métadonnées fournissant un profil moléculaire global de couvertures d'études sur le cancer spécifiques.
• Intégration API en Direct : Récupère des données génomiques en temps réel, garantissant que l'IA fournit les informations biologiques les plus récentes.
• UI basée sur React : Visualisations haute fidélité qui vont au-delà de simples descriptions textuelles.

Installation

• Claude Desktop : Ajoutez à claude_desktop_config.json :

{
  "mcpServers": {
    "cbio-oncoprint": {
      "command": "npm",
      "args": ["run", "start:server"],
      "cwd": "/path/to/cbio-oncoprint-mcp"
    }
  }
}

Hôtes supportés

• Claude