DeepMap MCP

Ce qu'il fait\nFournit aux LLM un accès structuré aux données DepMap (Cancer Dependency Map) du Broad Institute. Il agit comme un pont à faible latence pour effectuer des analyses de génomique fonctionnelle sur plus de 1 000 lignées cellulaires cancéreuses, spécifiquement optimisé pour la collecte de preuves sur les cibles thérapeutiques.\n\n## Outils\n- search_depmap_gene : Rechercher des symboles de gènes HGNC valides dans le jeu de données.\n- get_depmap_gene_dependency_summary : Récupérer les métriques statistiques globales (effet moyen du gène, scores de confiance) pour un gène spécifique.\n- get_depmap_top_cell_line_dependencies : Identifier les modèles de cancer les plus sensibles à la perte d'un gène cible.\n- get_depmap_dataset_metadata : Accéder aux données de provenance concernant le cache CRISPR local.\n\n## Installation\nAjoutez ceci à votre fichier claude_desktop_config.json :\n\njson\n{\n "mcpServers": {\n "deepmap-mcp": {\n "command": "deepmap-mcp",\n "args": ["--transport", "stdio"],\n "env": {\n "DEEPMAP_MCP_DATASET_PATH": "/VOTRE/CHEMIN/ABSOLU/VERS/CRISPRGeneEffect.csv"\n }\n }\n }\n}\n\n\n## Hôtes supportés\nClaude Desktop