
OakVar MCP
par miliyarsh
Interface d'analyse de variantes génomiques pour assistants IA, permettant des pipelines d'annotation et des requêtes de base de données via OakVar.
Ce qu'il fait
OakVar MCP expose les puissantes capacités d'analyse de variantes génomiques d'OakVar aux assistants IA. Il permet aux utilisateurs de gérer des modules d'annotation, d'exécuter des pipelines d'annotation complexes et d'interroger des bases de données de résultats génomiques en langage naturel.
Outils
oakvar_run: Exécute le pipeline d'annotation génomique.oakvar_module_install: Installe de nouveaux modules d'annotation génomique.oakvar_query: Exécute des requêtes SQL contre les bases de données de résultats.oakvar_report: Génère des rapports d'analyse aux formats VCF, Excel ou CSV.oakvar_system_check: Vérifie l'état de l'installation locale d'OakVar.
Installation
Ajoutez les éléments suivants à votre fichier claude_desktop_config.json :
{
"mcpServers": {
"oakvar": {
"command": "oakvar-mcp"
}
}
}
Hôtes supportés
- Claude Desktop
- ChatGPT Desktop
Installation rapide
pip install oakvar oakvar-mcpInformations
- Tarification
- free
- Publié
- 5/2/2026
- étoiles






