de aiskillstore
Importe, traite et compare des spectres de spectrométrie de masse (mzML/MGF/MSP) avec des filtres, des métriques de similarité et des pipelines reproductibles pour les flux de travail métabolomiques.
MatchMS fournit une boîte à outils Python complète pour le traitement des données de spectrométrie de masse : import/export de fichiers mzML, MGF, MSP et JSON, harmonisation des métadonnées, filtrage des pics, calcul de la similarité spectrale (cosinus, cosinus modifié, perte neutre) et construction de pipelines de traitement reproductibles pour la métabolomique. Les cas d'utilisation concrets incluent la recherche en bibliothèque, le filtrage QC et le regroupement basé sur la similarité à grande échelle.
Utilisez ce skill lorsque vous devez prétraiter des spectres bruts LC/MS ou GC/MS, normaliser et filtrer les pics, effectuer une correspondance de bibliothèque ou calculer des similarités spectrales deux à deux pour identifier des composés ou annoter des inconnus. Il convient aux pipelines de traitement par lots, à la reproductibilité de la recherche et à l'intégration aux flux de travail de type GNPS.
Probablement utilisé par des agents et des environnements capables d'exécuter du Python (Codex/Copilot/Claude Code) qui peuvent exécuter ou concevoir des pipelines d'analyse Python.
MatchMS is a mass spectrometry data processing Python library skill. The SKILL.md is well-structured with clear sections, code examples, and references to supplementary docs. No scripts were included, so only static analysis was performed. No security concerns — no network calls, no shell execution, no credentials. The skill is niche: targets metabolomics researchers working with MS data, a small audience relative to general agent skill users.
Clean, well-documented skill with no security issues. Low usefulness score reflects the narrow audience (metabolomics/MS researchers) rather than quality. Architecture is good with proper frontmatter and separation of concerns via references/. Code quality is high with clear examples and installation instructions. Minor deduction on architecture for heavy delegation to references/ files that may not be available.
