Recherche et récupération bioRxiv / medRxiv

Ce que fait cet outil

Fournit deux outils pour travailler avec les preprints de biologie et de médecine : une recherche par mot-clé/catégorie et fenêtre de date (query_biorxiv) pour parcourir les preprints récents, et un récupérateur basé sur le DOI (download_biorxiv_by_doi) qui renvoie les métadonnées complètes, l'historique des versions et les liens XML JATS pour un preprint donné. Utile pour trouver des preprints de pointe, récupérer les versions originales ou obtenir du XML lisible par machine pour un traitement ultérieur.

Quand l'utiliser

• Trouver des preprints récents dans un domaine spécifique (ex: "bioinformatics" au cours des 7 derniers jours).
• Retrouver un article publié à partir de son preprint via le DOI.
• Récupérer les métadonnées complètes + le XML JATS pour des pipelines d'entraînement ou d'analyse.
• Rassembler les historiques de versions et les informations de licence pour des vérifications de provenance.

Ce qui est inclus

• Scripts : aucun script groupé avec le fichier SKILL.md, mais la compétence documente deux outils d'agent attendus dans le projet (query_biorxiv et download_biorxiv_by_doi).
• Références : liens vers l'API bioRxiv et les pages d'accueil.
• Instructions : modèles d'utilisation clairs et pièges courants (choix du serveur, normalisation du DOI, gestion des articles retirés).

Agents compatibles

Cette compétence est un ensemble d'outils orientés backend, adapté aux agents disposant de capacités HTTP / tooling (Claude Code, agents de type Copilot, ou environnements d'agents personnalisés pouvant appeler des outils de projet).