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de scp148
Validez les séquences de protéines, calculez les propriétés biochimiques, prédisez la structure 3D (ESMFold) et analysez les poches de liaison — caractérisation complète des protéines de bout en bout.
Fournit un flux de travail pour la caractérisation complète des protéines : validation de séquence, analyse de caractéristiques, calcul de paramètres physico-chimiques, prédiction de structure 3D (ESMFold) et prédiction de poches de liaison (fpocket). La compétence orchestre des appels à plusieurs serveurs et outils SCP pour produire un pipeline d'analyse complète des protéines.
Utilisez cette compétence lorsque vous avez besoin d'un pipeline reproductible pour analyser une séquence d'acides aminés — de la validation basique à la prédiction de structure et la détection de poches. Adapté aux biologistes computationnels, aux chercheurs en découverte de médicaments et aux praticiens de la bioinformatique souhaitant une analyse automatisée de bout en bout.
Compatibilité déduite : agents capables d'appeler des serveurs MCP externes et d'établir des connexions HTTP/SSE/flux authentifiées. Idéalement utilisé par des agents ou runners ayant un accès réseau et la capacité de gérer les clés API pour SCP Hub.
Compétence en bioinformatique pour la caractérisation complète des protéines (validation de séquence, calcul de propriétés, prédiction de structure 3D via ESMFold, analyse des poches de liaison via fpocket). Orchestre 5 outils sur 4 serveurs MCP hébergés sur scp.intern-ai.org.cn. Aucun script intégré — uniquement SKILL.md. L'exemple d'utilisation Python contient des clauses except vides et appelle des outils avec des arguments vides arguments={}, manquant des paramètres requis comme l'entrée de séquence. Nécessite une clé API SCP Hub pour être utilisée. Outil scientifique niche mais légitime.
Compétence bioinformatique légitime. La qualité du code est diminuée par les clauses except vides et les paramètres d'arguments manquants dans l'exemple d'utilisation. L'architecture est simple (un seul SKILL.md, pas de répertoires scripts/references). Utilité niche — nécessite un accès spécifique à la plateforme et un contexte bioinformatique.
Seq Wrangler
Sequence data QC, trimming, alignment, and BAM processing pipeline helper — wraps FastQC, fastp/Trimmomatic, BWA/Bowtie2/Minimap2, and SAMtools for automated re
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