Packages SKILL.md qui étendent Claude Code, Cursor, Copilot et autres agents IA.
Étiquettes
bioskills
Exécute l'enrichissement des voies et modules KEGG via clusterProfiler (enrichKEGG/enrichMKEGG) pour identifier les voies métaboliques et de signalisation sur-représentées dans une liste de gènes.
skills
Génère des plans d'études de toxicologie de réseau + docking moléculaire à quatre niveaux (Lite → Publication+) avec des flux de travail étape par étape, des stratégies de validation et des plans de figures.
Bizard
Un atlas complet de tutoriels et d'exemples de visualisation de données biomédicales (R/Python/Julia) fournissant du code reproductible et des conseils pour les graphiques utilisés en bioinformatique.
scienceclaw
Passerelle d'agent unifiée vers plus de 1000 outils scientifiques (bio-informatique, découverte de médicaments, génomique) via ToolUniverse de Harvard, retournant du JSON pour les flux de travail en aval.
kosmos
Skill de traitement de données de spectrométrie de masse : import/export mzML/MGF/MSP, application de filtres, calcul de similarité spectrale et création de pipelines de traitement reproductibles.
clawbio
Exécute l'analyse de l'expression différentielle sur la protéomique quantitative sans marquage (MaxQuant, DIA-NN), incluant le prétraitement, l'imputation, les tests statistiques et la visualisation.
openclaw-medical-skills
Extrait les appels de méthylation par cytosine (CpG/CHG/CHH) à partir de BAMs alignés par Bismark et produit des rapports bedGraph/couverture pour l'analyse en aval.
internta
Agent scientifique multi-expert pour la découverte de médicaments et la recherche biomédicale qui instancie des spécialistes de domaine, intègre des preuves multimodales et génère des analyses.
openclaw-medical-skills
Aide au pipeline de contrôle qualité, trimming, alignement et traitement BAM de données de séquençage — encapsule FastQC, fastp/Trimmomatic, BWA/Bowtie2/Minimap2 et SAMtools.
immunopipe
Intègre les données de répertoire scTCR/BCR dans un objet Seurat scRNA-seq via scRepertoire::combineExpression pour permettre l'analyse et la visualisation d'expressions basées sur les clonotypes.
biomcp
Boîte à outils orientée CLI pour découvrir et récupérer des entités biomédicales (gènes, variants, médicaments, essais, diagnostics, articles) et exécuter des flux de travail structurés de littérature et de données.
alterlab-academic-skills
Recherchez et interprétez les données de variants de NCBI ClinVar, accédez-y via E-utilities ou FTP, annotez les VCF et intégrez les meilleures pratiques de statut de révision et de preuves pour la génotypage.
