MCP App StoreMCP App StorePackages SKILL.md qui étendent Claude Code, Cursor, Copilot et autres agents IA.
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alterlab-academic-skills
Recherchez et interprétez les données de variants de NCBI ClinVar, accédez-y via E-utilities ou FTP, annotez les VCF et intégrez les meilleures pratiques de statut de révision et de preuves pour la génotypage.
bioskills
Exécute l'enrichissement des voies et modules KEGG via clusterProfiler (enrichKEGG/enrichMKEGG) pour identifier les voies métaboliques et de signalisation sur-représentées dans une liste de gènes.
skills
Génère des plans d'études de toxicologie de réseau + docking moléculaire à quatre niveaux (Lite → Publication+) avec des flux de travail étape par étape, des stratégies de validation et des plans de figures.
biomcp
Boîte à outils orientée CLI pour découvrir et récupérer des entités biomédicales (gènes, variants, médicaments, essais, diagnostics, articles) et exécuter des flux de travail structurés de littérature et de données.
scienceclaw
Passerelle d'agent unifiée vers plus de 1000 outils scientifiques (bio-informatique, découverte de médicaments, génomique) via ToolUniverse de Harvard, retournant du JSON pour les flux de travail en aval.
awesome-bio-agent-skills
Recherchez des prépublications récentes sur arXiv et créez des résumés Markdown locaux ; idéal pour la découverte de littérature en informatique, mathématiques, physique et biologie quantitative.
kosmos
Skill de traitement de données de spectrométrie de masse : import/export mzML/MGF/MSP, application de filtres, calcul de similarité spectrale et création de pipelines de traitement reproductibles.
Bizard
Un atlas complet de tutoriels et d'exemples de visualisation de données biomédicales (R/Python/Julia) fournissant du code reproductible et des conseils pour les graphiques utilisés en bioinformatique.
openclaw-medical-skills
Extrait les appels de méthylation par cytosine (CpG/CHG/CHH) à partir de BAMs alignés par Bismark et produit des rapports bedGraph/couverture pour l'analyse en aval.
clawbio
Exécute l'analyse de l'expression différentielle sur la protéomique quantitative sans marquage (MaxQuant, DIA-NN), incluant le prétraitement, l'imputation, les tests statistiques et la visualisation.
internta
Agent scientifique multi-expert pour la découverte de médicaments et la recherche biomédicale qui instancie des spécialistes de domaine, intègre des preuves multimodales et génère des analyses.
immunopipe
Intègre les données de répertoire scTCR/BCR dans un objet Seurat scRNA-seq via scRepertoire::combineExpression pour permettre l'analyse et la visualisation d'expressions basées sur les clonotypes.
openclaw-medical-skills
Aide au pipeline de contrôle qualité, trimming, alignement et traitement BAM de données de séquençage — encapsule FastQC, fastp/Trimmomatic, BWA/Bowtie2/Minimap2 et SAMtools.
awesome-bio-agent-skills
Interrogez l'API AlphaFold EBI pour récupérer des structures de protéines prédites, télécharger des fichiers PDB/CIF et inspecter les métriques de confiance (pLDDT/PAE).
awesome-bio-agent-skills
Exécutez des analyses de génétique des populations de style DnaSP (π, D de Tajima, LD, MK, Ka/Ks, SFS) sur des séquences alignées localement et produisez des rapports TSV/Markdown.
awesome-omni-skill
Traitement de données génomiques haute performance avec polars-bio et Polars : gestion streaming VCF/FASTA/BED, jointures d'intervalles, annotation de variantes et conversion Parquet
claude-code-templates
Interrogez le catalogue GWAS de NHGRI-EBI pour les associations SNP-trait, la recherche de variants, la recherche de traits et les statistiques sommaires pour l'épidémiologie génétique et les travaux de PRS.
alterlab-academic-skills
Recherche et récupération de prépublications en sciences de la vie depuis bioRxiv via API.
auto-college
Construisez et analysez des arbres évolutifs à l'aide de MAFFT, IQ-TREE 2 et FastTree avec une visualisation via ETE3.
alterlab-academic-skills
Interrogez la Cancer Dependency Map (DepMap) pour obtenir des scores de dépendance génique, la sensibilité aux médicaments et les vulnérabilités génétiques spécifiques au cancer.
Bioclaw Skills Hub
Flux de travail complet de métagénomique shotgun incluant le QC d'épuisement de l'hôte, le profilage taxonomique, l'analyse fonctionnelle et les résumés AMR.
immunopipe
Isole les cellules T et B à partir de populations cellulaires mixtes en utilisant des données VDJ, des gènes marqueurs ou le clustering k-means.
LunarTech-X Superpowers
Accès programmatique au Catalogue des Mutations Somatiques dans le Cancer (COSMIC) pour la génomique du cancer et la recherche en oncologie de précision.
operon
Contrôle qualité complet pour la cytométrie de flux, spectrale et de masse afin de supprimer les artéfacts d'acquisition et de signaler les échantillons aberrants.
awesome-bio-agent-skills
Pipeline de bout en bout pour l'analyse de l'épissage alternatif par RNA-seq bulk à lectures courtes : QC, alignement STAR en 2 passes, QC des jonctions, épissage différentiel rMATS, commutation d'isoformes.
claude-code-templates
Accédez à la base de données d'enzymes BRENDA via l'API SOAP pour récupérer les paramètres cinétiques, les réactions, les données sur les organismes et les informations sur les enzymes spécifiques aux substrats.
claude-code-templates
Interrogez ChEMBL par programmation pour récupérer des données sur les molécules bioactives, des mesures de bioactivité, des cibles et effectuer des recherches de similitude/sous-structure pour la découverte de médicaments.
bioskills
Détecte les blocs de gènes synténiques et les réarrangements structurels entre génomes à l'aide de MCScanX, JCVI, GENESPACE, SyRI, AnchorWave et d'outils connexes ; conseils sur le pipeline.
operon
Analysez, filtrez et trimmez les scores de qualité des lectures de séquences FASTQ à l'aide de Biopython pour garantir des données génomiques de haute qualité.
kosmos
Accédez et interrogez l'API REST d'Ensembl pour la recherche de gènes, la récupération de séquences, l'annotation de variantes (VEP), les orthologues et la génomique comparative pour plus de 250 espèces.