MCP App StoreMCP App StorePackages SKILL.md qui étendent Claude Code, Cursor, Copilot et autres agents IA.
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bioskills
Détecte les blocs de gènes synténiques et les réarrangements structurels entre génomes à l'aide de MCScanX, JCVI, GENESPACE, SyRI, AnchorWave et d'outils connexes ; conseils sur le pipeline.
alterlab-academic-skills
Recherchez et interprétez les données de variants de NCBI ClinVar, accédez-y via E-utilities ou FTP, annotez les VCF et intégrez les meilleures pratiques de statut de révision et de preuves pour la génotypage.
bioskills
Exécute l'enrichissement des voies et modules KEGG via clusterProfiler (enrichKEGG/enrichMKEGG) pour identifier les voies métaboliques et de signalisation sur-représentées dans une liste de gènes.
skills
Génère des plans d'études de toxicologie de réseau + docking moléculaire à quatre niveaux (Lite → Publication+) avec des flux de travail étape par étape, des stratégies de validation et des plans de figures.
claude-code-templates
Interrogez ChEMBL par programmation pour récupérer des données sur les molécules bioactives, des mesures de bioactivité, des cibles et effectuer des recherches de similitude/sous-structure pour la découverte de médicaments.
kosmos
Accédez et interrogez l'API REST d'Ensembl pour la recherche de gènes, la récupération de séquences, l'annotation de variantes (VEP), les orthologues et la génomique comparative pour plus de 250 espèces.
biomcp
Boîte à outils orientée CLI pour découvrir et récupérer des entités biomédicales (gènes, variants, médicaments, essais, diagnostics, articles) et exécuter des flux de travail structurés de littérature et de données.
Bizard
Un atlas complet de tutoriels et d'exemples de visualisation de données biomédicales (R/Python/Julia) fournissant du code reproductible et des conseils pour les graphiques utilisés en bioinformatique.
awesome-bio-agent-skills
Recherchez des prépublications récentes sur arXiv et créez des résumés Markdown locaux ; idéal pour la découverte de littérature en informatique, mathématiques, physique et biologie quantitative.
kosmos
Skill de traitement de données de spectrométrie de masse : import/export mzML/MGF/MSP, application de filtres, calcul de similarité spectrale et création de pipelines de traitement reproductibles.
scienceclaw
Passerelle d'agent unifiée vers plus de 1000 outils scientifiques (bio-informatique, découverte de médicaments, génomique) via ToolUniverse de Harvard, retournant du JSON pour les flux de travail en aval.
openclaw-medical-skills
Extrait les appels de méthylation par cytosine (CpG/CHG/CHH) à partir de BAMs alignés par Bismark et produit des rapports bedGraph/couverture pour l'analyse en aval.
awesome-bio-agent-skills
Pipeline de bout en bout pour l'analyse de l'épissage alternatif par RNA-seq bulk à lectures courtes : QC, alignement STAR en 2 passes, QC des jonctions, épissage différentiel rMATS, commutation d'isoformes.
clawbio
Exécute l'analyse de l'expression différentielle sur la protéomique quantitative sans marquage (MaxQuant, DIA-NN), incluant le prétraitement, l'imputation, les tests statistiques et la visualisation.
awesome-skills-cn
Interroge gnomAD pour obtenir les fréquences alléliques de population, les annotations de conséquences de variantes et les scores de contrainte génique pour soutenir l'interprétation des variantes et la génétique de population.
internta
Agent scientifique multi-expert pour la découverte de médicaments et la recherche biomédicale qui instancie des spécialistes de domaine, intègre des preuves multimodales et génère des analyses.
immunopipe
Intègre les données de répertoire scTCR/BCR dans un objet Seurat scRNA-seq via scRepertoire::combineExpression pour permettre l'analyse et la visualisation d'expressions basées sur les clonotypes.
scp
Validez les séquences de protéines, calculez les propriétés biochimiques, prédisez la structure 3D (ESMFold) et analysez les poches de liaison — caractérisation complète des protéines de bout en bout.
openclaw-medical-skills
Aide au pipeline de contrôle qualité, trimming, alignement et traitement BAM de données de séquençage — encapsule FastQC, fastp/Trimmomatic, BWA/Bowtie2/Minimap2 et SAMtools.
claude-code-templates
Accédez à la base de données d'enzymes BRENDA via l'API SOAP pour récupérer les paramètres cinétiques, les réactions, les données sur les organismes et les informations sur les enzymes spécifiques aux substrats.
asb-skill-collections
Transformez et collationnez des enregistrements tabulaires en dictionnaires JSON structurés à l'aide du mappage de champs, du filtrage et du regroupement pour les métadonnées scientifiques.
asb-skill-collections
Extraire et déconvoluer des spectres de fragmentation individuels à partir de données de spectrométrie de masse composites pour l'annotation en métabolomique et exposomique.
asb-skill-collections
Automatise l'exportation des résultats de contrôle qualité de métabolomique LC-MS vers des graphiques prêts pour la publication, des rapports HTML et des tableaux de données.
asb-skill-collections
Validez les données de spectrométrie de masse Orbitrap en vérifiant les métadonnées de l'instrument et en quantifiant les rapports signal sur bruit des ions fragments.
asb-skill-collections
Récupère, extrait et standardise les archives de jobs de réseautage moléculaire GNPS pour l'intégration NPLinker.
asb-skill-collections
Remplace les valeurs zéro et manquantes dans les tables de caractéristiques métabolomiques LC-MS en utilisant une interpolation basée sur la valeur minimale.
asb-skill-collections
Résout les lacunes métaboliques dans les reconstructions de consensus individuelles en exploitant le contexte partagé au sein de communautés microbiennes ou végétales multi-membres.
asb-skill-collections
Coordonnez des pipelines bioinformatiques complexes sur des environnements HPC et cloud avec des graphes de tâches reproductibles et conteneurisés.
claude-skill-registry
Prédisez le contenu fonctionnel du métagénome et déduisez les abondances KEGG, MetaCyc et EC à partir de données de gènes marqueurs ARNr 16S.
operon
Contrôle qualité complet pour la cytométrie de flux, spectrale et de masse afin de supprimer les artéfacts d'acquisition et de signaler les échantillons aberrants.