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de immunopipe21
Isole les cellules T et B à partir de populations cellulaires mixtes en utilisant des données VDJ, des gènes marqueurs ou le clustering k-means.
Cette compétence fournit une méthodologie robuste pour séparer les cellules T et B d'une population cellulaire mixte dans des ensembles de données scRNA-seq et VDJ-seq. Elle permet une isolation de haute précision des cellules pertinentes avant de procéder à une analyse spécifique au TCR ou au BCR.
Utilisez cette compétence lorsque votre ensemble de données contient des types cellulaires mixtes et que vous devez identifier quels clusters sont spécifiquement des cellules T ou B. Elle est particulièrement utile après le clustering initial Seurat mais avant l'analyse approfondie du répertoire immunitaire.
Conçue pour les agents capables de gérer des pipelines bioinformatiques basés sur R, spécifiquement ceux intégrés au framework immunopipe.
Cette compétence n'a pas encore été examinée par notre pipeline d'audit automatisé.
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