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Bibliothèque de traitement et d'analyse de spectrométrie de masse pour l'importation de fichiers mzML/MGF/MSP, l'harmonisation des métadonnées, le filtrage des pics et le calcul de similitudes spectrales.
MatchMS ajoute des capacités robustes de traitement de données de spectrométrie de masse : import/export via des formats courants (mzML, MGF, MSP, JSON), normalisation et filtrage de spectres, harmonisation des métadonnées, dérivation d'identifiants chimiques (InChI/SMILES) et calcul de scores de similitude spectrale (cosinus, cosinus modifié, basé sur les empreintes). Il est conçu pour construire des pipelines d'analyse reproductibles pour l'appariement de bibliothèques, le contrôle qualité et les comparaisons de similitude à grande échelle.
Utilisez cette compétence lorsque vous devez prétraiter des données MS brutes, standardiser les métadonnées entre les fichiers, exécuter le filtrage et la normalisation des pics, ou effectuer l'appariement et le scoring de bibliothèques spectrales. Les scénarios typiques incluent l'identification métabolomique, le réseautage spectral et la recherche automatisée de bibliothèques pour des spectres inconnus.
references/.Cette compétence est indépendante de l'implémentation mais est plus utile pour les agents compatibles Python ou les agents de type Claude/Copilot capables de produire/exécuter du code Python et de travailler avec des packages scientifiques.
Compétence de documentation uniquement pour la bibliothèque Python matchms (traitement de données de spectrométrie de masse). Aucun script intégré — contenu purement de référence avec des exemples de code pour l'importation/exportation de données MS, le filtrage, la similitude spectrale et la construction de pipelines. SKILL.md est bien structuré avec des sections claires et des pointeurs vers un répertoire references/, mais est entièrement statique sans logique exécutable ni contrats de sortie.
Compétence propre et bénigne — juste de la documentation pour une bibliothèque Python scientifique spécialisée. Aucune préoccupation de sécurité. Le faible score d'utilité reflète l'audience extrêmement restreinte (chercheurs en spectrométrie de masse / métabolomique).
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